Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer

1st android aplikacja do analizy żeli (agarozowym i strona) zespoły ze skalowaniem dziennika

* Zgodnie ze zmianami systemu operacyjnego Android, należy uzyskać dostęp do lokalnych plików za pomocą ES File Explorer, który spowoduje rootowanie napędów / kart SD. Będziesz musiał przejść do ES File Explorer, aby najpierw wykonać rootowanie. Pamiętaj, że obsługa Dropbox została usunięta z powodu zmian w Androidzie i Dropbox.

Jest to pierwsza aplikacja na Androida, która pozwala analizować pasma żelu (zarówno agarozowe, jak i PAGE) za pomocą wykresu dziennika automatycznie generowanego ze znaczników. Umożliwia automatyczne wykrywanie i ładowanie do przyszłych zastosowań. Wykorzystując filtr Gabora, ta aplikacja pozwala użytkownikom automatycznie poprawić wykrywanie pasm. W przypadku słabej jakości obrazów użytkownicy mogą kliknąć, aby ręcznie narysować ramkę na wybranym paśmie lub kliknąć obraz, aby określić określone położenie.

Obrazy mogą być ładowane z galerii lub dropboxa, dzięki czemu jest to bardzo wygodne. Najlepsze obrazy to te generowane przez skanery, ale będą działać z dobrze zrobionymi zdjęciami z kamer mobilnych.

Zdjęcia należy wykonywać bezpośrednio na płaszczyźnie z żelem.

Funkcje tej aplikacji obejmują:

1) Specyfikacja agarozy lub PAGE.

2) Identyfikacja kolorów pasm markerów dla PAGE.

3) Zaawansowane filtry obrazowania - Garbor.

4) Zautomatyzowane przetwarzanie obrazu z dostosowanym wejściem użytkownika, jeśli to konieczne.

5) Zapisywanie ustawień przetwarzania obrazu dla przyszłej wygody.

6) Zapisywanie znaczników dla przyszłej wygody przy użyciu tych samych znaczników.

7) Prosty i oparty na przycisku interfejs użytkownika.

8) Automatyczne wykrywanie pasm.

9) Prosta, zdefiniowana przez użytkownika skrzynka graniczna.

10) automatycznie generowany wykres znaczników markera.

11) Określona przez użytkownika lokalizacja konkretnych pasm.

12) Zgodność z widokiem krajobrazowym i portretowym tabletów i smartfonów o wielu rozmiarach.

13) Zgodność z funkcjami zrzutów ekranowych analizowanych smartfonów i tabletów z logiem i logem do publikacji lub raportów.

14) Odczyty wyświetlane na obrazie żelowym z podświetlonymi polami i obliczonym rozmiarem pasma.

15) Funkcja kadrowania zdjęć przed analizą.

16) Edytuj funkcję, aby usunąć niechciane pasma.

17) Różne kolorowe pudełka na znaczniki i taśmy.

18) Prosty bezpośredni dostęp do galerii obrazów dla obrazów.

19) Kompatybilny z analizą żelu agarozowego Sybr Green, EtBr.

20) Bezpośredni dostęp do kamery.

Korzyści z używania tej aplikacji do publikacji

1) Zapewnia lepszą dokładność analizy żelu, zamiast polegać na przybliżeniach.

2) Wartość dodaje do publikacji i raportów.

3) Przydatne narzędzie nauczania dla studentów kierunków ścisłych.

4) Usprawniona analiza, redukująca błędy ludzkie i subiektywność - teraz możesz zaufać wartościom zgłoszonym przez uczestników i mniej doświadczonych pracowników!

5) Analiza na bieżąco ze smartfonem / tabletem.

6) Zautomatyzowana analiza - nie ma potrzeby stosowania papieru milimetrowego i żmudnego kreślenia.

7) Aplikacja jest DARMOWA!

8) Aplikacja jest samodzielna, nie jest potrzebny dostęp do Internetu (chyba że do analizy skrzynki dropbox).

Użytkownicy Androida 6 mogą uzyskać obrazy z lokalnej galerii "Obraz". Wcześniejsze wersje Androida będą obsługiwać Dropbox. Jest to spowodowane zmianami w systemie Android 6 i jest poza naszą kontrolą.

Aby uzyskać instrukcje użytkowania, obejrzyj film na stronie https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be

Userguide dostępny jako pdf na stronie http://tinyurl.com/GelApp

* Najnowsze telefony, np. Samsung Note 8 może mieć problemy z zapisaniem aparatu. Jeśli występują takie problemy, skorzystaj z galerii.

Aby zacytować, użyj:

Sim, JZ. *, Nguyen, PV. *, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: Mobilny analizator elektroforezy żelowej. Uwagi do metod natury. doi: 10,1038 / an9643

LUB do oprogramowania bezpośrednio w sklepie App Store

Sim, J.Z., Nguyen, P.V., Gan, S.K.E. (2014) GelApp: DNA & Prot Gel Analyzer v1.2. [Aplikacje mobilne]. Źródło: https://play.google.com

Ta aplikacja jest produktem Laboratorium rozwoju przeciwciał i produktów, działu badań translacyjnych, Instytutu Bioinformatyki, Agencji ds. Nauki, Technologii i Badań, Singapur.

Twórcami są: Pan SIM Jia Zhi, Pan NGUYEN Phi Vu oraz Dr Samuel GAN.

                    (Poly intern) (Research Officer) (Asystent Głównego Badacza)